Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GatbQ99JT1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GatbQ99JT1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms