Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSPG4P5Q96PW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms