Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT3

PRICKLE1, Prickle-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE1Q96MT3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRICKLE1Q96MT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE1Q96MT3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms