Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC17Q96LX7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC17Q96LX7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms