Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1bQ91YK2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1bQ91YK2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms