Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf428Q8C1M2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Znf428Q8C1M2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf428Q8C1M2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms