Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pggt1bQ8BUY9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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