Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo38Q8BMI0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo38Q8BMI0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo38Q8BMI0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo38Q8BMI0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo38Q8BMI0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo38Q8BMI0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms