Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan9Q8BJU2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan9Q8BJU2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms