Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctdspl2Q8BG15 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctdspl2Q8BG15 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctdspl2Q8BG15 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms