Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Smim12Q78RX3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms