Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2b4Q6Q477 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2b4Q6Q477 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms