Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp49Q6P9L4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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