Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg16l2Q6KAU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg16l2Q6KAU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms