Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms