Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim27Q62158 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim27Q62158 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms