Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Laptm4aQ60961 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Laptm4aQ60961 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms