Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sco1Q5SUC9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sco1Q5SUC9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms