Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps54Q5SPW0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps54Q5SPW0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps54Q5SPW0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms