Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85aQ5SP85 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc85aQ5SP85 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms