Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap74Q3UY96 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap74Q3UY96 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cfap74Q3UY96 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms