Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd3l2Q3UXB0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd3l2Q3UXB0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms