Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep63Q3UPP8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep63Q3UPP8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms