Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cops9Q3U898 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cops9Q3U898 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cops9Q3U898 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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