Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calr4Q3TQS0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Calr4Q3TQS0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms