Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSC1Q08554 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms