Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sec23aQ01405 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms