Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gabpb2P81069 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms