Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfi1P70338 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfi1P70338 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfi1P70338 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms