Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ElobP62869 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ElobP62869 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ElobP62869 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ElobP62869 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ElobP62869 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ElobP62869 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ElobP62869 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ElobP62869 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ElobP62869 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms