Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23aP62751 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23aP62751 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms