Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan5P62080 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms