Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO4P61968 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO4P61968 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO4P61968 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMO4P61968 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMO4P61968 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LMO4P61968 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LMO4P61968 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LMO4P61968 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMO4P61968 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMO4P61968 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO4P61968 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms