Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gsc2P56916 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gsc2P56916 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1454.9 ms