Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Faf1P54731 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms