Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkn1cP49919 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdkn1cP49919 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms