Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab11bP46638 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab11bP46638 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms