Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjb1P28230 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjb1P28230 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms