Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarsP26638 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SarsP26638 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarsP26638 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SarsP26638 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SarsP26638 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SarsP26638 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SarsP26638 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarsP26638 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarsP26638 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarsP26638 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarsP26638 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarsP26638 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarsP26638 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SarsP26638 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarsP26638 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms