Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col8a2P25318 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col8a2P25318 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms