Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RCC1P18754 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RCC1P18754 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms