Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka3P18654 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms