Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18528 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P18528 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18528 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18528 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18528 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18528 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18528 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms