Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsdP18242 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtsdP18242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsdP18242 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsdP18242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtsdP18242 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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