Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmnb1P14733 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmnb1P14733 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms