Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA4P13612 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms