Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna9P09235 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna9P09235 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms