Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa5P09021 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa5P09021 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms