Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna5P07349 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms