Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFMP07197 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFMP07197 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFMP07197 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFMP07197 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFMP07197 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFMP07197 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFMP07197 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFMP07197 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFMP07197 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms